Pod koniec lat 90. reżyser współuczestniczył w pracach nad serialem Szczepan i Irenka Elżbiety Wróblewskiej, który podobnie jak "Erotyczne zwierzenia" emitowany był w Canal+. Realizował również kolejne animacje autorskie: "Welcome in Cybersex" (1999), "Psy" (2000), "ZTV - telewizja dla zwierząt" oraz "Próżnia" (2001).
W 2000 roku powstała też animacja "Z pamiętnika młodej lekarki – konsumpcja", na podstawie tekstu Ewy Szumańskiej i z wykorzystaniem głosów autorki radiowego cyklu oraz Jana Kaczmarka. Także w tych filmach znajdziemy ironiczny obraz polskiej rzeczywistości tuż po transformacji, z narastającymi zjawiskami komercjalizacji, konsumpcjonizmu, a jednocześnie nadal widoczną siermiężnością, prowincjonalnością i mentalnością, które pozostały po okresie PRL-u. Taka siermiężna - choć z aspiracjami do nowoczesności – rzeczywistość została uchwycona w filmie "Próżnia" z podtytułem "podróż w nicość". Oto "niewielki kraj w środku Europy oczekuje właśnie na pierwszy w swojej historii start rakiety załogowej". Dwóch śmiałków mknie w przestworza rakietą Kopernik–7, "dumą krajowej technologii", żegnając ojczysty kraj ze snopkami zbóż i szarymi blokowiskami, by wypełnić powierzoną im misję. Profesor, jeden z uczestników wyprawy, z trudem rozstaje się z ukochanymi lekturami, których zestaw nie jest zbyt obszerny – "Pan Tadeusz", "Chłopi", podręcznik do fizyki – klasa ósma i chemii. Przekazany im przez generała dokument, który odczytują już w kosmosie, okazuje się prozaiczną listą zakupową, zapełnioną podstawowymi dla polskiej diety produktami. Zabawna historyjka, pełna absurdalnego humoru, z celowo niezdarnymi i niedbałymi rysunkami oraz pokracznymi nieco postaciami, obfituje w celne, boleśnie prawdziwe spostrzeżenia dotyczące polskiej rzeczywistości i relacji międzyludzkich. Animowana "Próżnia" także została przeniesiona na papier i opublikowana w magazynie "Arena Komiks". Koza jest też autorem komiksowej opowieści do antologii "Manga po polsku" czy zbioru "I co dalej kapitanie?", poświęconego przygodom kreskówkowej postaci, Kapitanowi MO Janowi Żbikowi. W 2007 roku, ponownie w wydawnictwie "Kultura Gniewu", ukazał się kolejny komiks Kozy, zatytułowany "Wszystko źle". Jak pisze wydawca, jest to:
Niezwykły przewodnik po codziennych sprawach, które dla wielu stanowią trudny do przebycia labirynt. Jan Koza, autor tego poradnika, przedstawia 'z życia wzięte' historie z morałem, by ostrzec czytelników przed grożącymi im niebezpieczeństwami – niewłaściwym lokowaniem uczuć, problemami zawodowymi i małżeńskimi, czy podłością bliźnich.