По заказу Большого театра — Национальной оперы в Варшаве написала камерную оперу «The Music Programme» (1999). Премьера спектакля в постановке Кшиштофа Варликовского состоялась 7 апреля 2000 года. Пануфник писала сочинения для крупнейших фестивалей и организаций, в том числе для фестиваля Holders Season на Барбадосе (опера «Инкле и Ярико», 1996), Фонда Джона Студзински для хора Вестминстерского собора («Вестминстерская месса», 1997), Королевской академии искусств («Весна» для смешанного хора и органа или фортепиано, 1997) и университета Брунеля («The Upside Down Sailor», 1998).
В 2011 году написала «Таллинскую мессу: танец жизни» для сопрано, двойного хора и оркестр, а также «Четыре сезона мира» для скрипки и струнного оркестра. Первая часть «Сезонов» посвящена скрипачке Тасмин Литтл, остальные — Анджею Пануфнику.
Важная задача Роксаны Пануфник — стирать границы между религиями. Первым ее проектом на эту тему стал концерт «Авраам», написанный для британского скрипача Дэниэла Хоупа. В этом сочинении композитор соединила элементы христианских, мусульманских и еврейских песен, чтобы подчеркнуть, что представители этих религий верят в одного бога. Премьера состоялась в 2008 году Иерусалиме и Лондоне, где композицию исполнял Оркестр для мира под руководством Валерия Гергиева.
Оперу Роксаны Пануфник «Серебряная береза», написанную в 2017 году специально для Гарсингтонской оперы, тепло приняла публика и критики. В 2018 году Пануфник по просьбе Симфонического оркестра Бримингема и Национального симфонического оркестра Польского радио создала ораторию «Faithful Journey – a Mass for Poland» в честь столетия польской независимости. В 2019 году получила заказ на сочинение для двух дирижеров и два хора, которое впоследствии исполняли Марин Элсоп и Валентина Пелегги из Симфонического оркестра Балтимора.
Интернет-сайт композитора: www.roxannapanufnik.com.