В прессе Ванькович печатал репортажи и письма из Польши и из-за границы. Так, в «Kurier Warszawski» публиковались его письма из путешествия в Мексику в 1926-27 годы. С 1930 года Ванькович числился членом польского ПЕН-клуба. В 1936 году писатель был удостоен «Серебряного Лавра» Польской академии литературы.
Премию Ваньковичу присудили прежде всего за его увлекательные, написанные в ярком запоминающемся стиле заметки из путешествий. В последние годы перед войной писатель с семьей — женой и дочерьми Крысей и Мартой — жил в Варшаве, в районе Жолибож, в знаменитом «Домике» на улице Дженникарской (Журналистской), о котором он с нежностью писал в «Трава на кратере».
Когда разразилась Вторая мировая война, Ванькович находился в Польше и успел недолгое время побыть военным корреспондентом на территории Любельщины. Но еще до капитуляции Варшавы 24 сентября, опасаясь ареста, поскольку немцы действительно разыскивали автора книги «На тропах Сментка», он уехал в Румынию. Здесь Ванькович быстро нашел себе занятие в среде поляков, эмигрировавших сразу после начала войны: читал лекции, писал статьи, публиковался под псевдонимами в выходящих в Бухаресте газетах «Kurier Polski» и «Dziennik Polski». В 1940 году на страницах «Дзенника» он напечатал цикл «В скитания…». Кроме этого, в Бухаресте Ванькович под псевдонимом Ежи Лужиц выпустил книгу о сражениях в Польше под названием «Эти первые бои».
Летом 1940 года Ванькович перебрался на юг Европы, а в сентябре того же года его вместе с другими поляками англичане эвакуировали на Кипр, откуда в 1941 году он уехал в Палестину. Главным занятием Ваньковича по-прежнему оставалась работа журналиста, репортера и публициста. Под псевдонимом Ежи Лужиц он писал для изданий «Dziennik Żołnierza», «Wiadomości Polskie» и «Głos Polski».
С 1943 года Ванькович был военным корреспондентом 2-го Корпуса, путешествовал по Ближнему Востоку. В мае 1944 года он участвовал в битве под Монте-Кассино, за что был награжден Крестом Храбрых.
После войны Мельхиор Ванькович не вернулся в Польшу. Его старшая дочь Крыся погибла в Варшавском восстании, «Домик» был разрушен, Варшавы не существовало. В 1947 году писатель поселился в Лондоне. Здесь он сотрудничал среди прочих с «Wiadomości» и «Dziennik Polski», писал репортажи и фельетоны, которые подписывал именем Адольф Чибыгдыбы. Его тексты зачастую задевали недавнюю польскую эмиграцию, так что неудивительно, что отношения Ваньковича с поляками, проживавшими в Лондоне, складывались не лучшим образом. А когда в 1947 году в Риме писатель издал сборник фельетонов под названием «Дворняжество» / «Kundlizm» [от пол. kundel — беспородная собака, дворняга], некоторые эмиграционные издания в знак протеста прекратили с ним сотрудничество.
Сразу же после войны Ванькович приступил к интенсивной работе над своей самой большой и значительной книгой, которая разрослась до трех томов, опубликованных в 1945-47 годах в Риме под названием «Битва за Монте-Кассино. Книга Ваньковича стала памятником солдатам-героям генерала Андерса. Примерно в то же время писатель также начал сотрудничать с прессой в Польше, печатался в «Przekrój» i «Nowiny Literackie» , а также в газете «Słowo Powszechne», издаваемой светской католической организацией PAX. Сотрудничество продлилось до 1949 года, когда Ванькович переехал в Соединенные Штаты. Здесь ему приходилось зарабатывать на жизнь не только писательским, но и физическим трудом, например, на ферме. Он преподавал русский язык и дальше занимался журналистикой, писал фельетоны и читал лекции. В 1956 году Ванькович получил американское гражданство. В том же году впервые с момента окончания войны он на несколько месяцев приехал в Польшу. Уже тогда, во время «оттепели», Ванькович подумывал вернуться на родину навсегда. С 1957 года он регулярно сотрудничал с польской прессой. Его статьи, репортажи и эссе начали выходить в «Przegląd Kulturalny», «Kierunki», «Tygodnik Powszechny». В последнем Ванькович публиковал тематические циклы: «Негры в США» и «Женщина в Америке», которые пользовались у читателей большой популярностью.
В Польшу Ванькович вернулся в мае 1958 года. По возвращении он занялся литературной деятельностью, читал лекции, выступал на радио и телевидении. В начале шестидесятых писатель снова уехал в Соединенные Штаты и целый год путешествовал по американскому континенту, собирая материал для новой книги.
У всего, что он писал — репортажей, рассказов, повестей — независимо от конкретной тематики много общего. Прежде всего Ванькович прекрасно владел сегодня уже исчезающим жанром устного рассказа, порожденным старинной польской шляхетской культурой. Он был превосходным рассказчиком, его проза изобилует анекдотами, лирическими отступлениями и прямыми обращениями к читателю-слушателю. В творчестве Ваньковича постоянно присутствует дух Кресов Речи Посполитой. Даже когда автор высмеивает те давно минувшие времена и подчеркивает их анахроничность, этот дух не только не теряет своей силы, но напротив — только крепнет. Ванькович до конца жизни оставался «кресовым» писателем. Ведь именно здесь, в этой традиции и шляхетском прошлом корни его веры и восхищения всем, что рвется к жизни. Творчество Ваньковича теснейшим образом связано со стихией природы, его герой — ее частица, и ему предстоит найти в природе свое место. Поэтому проза Ваньковича пульсирует как артерия, в ней нет лишних долгот и фрагментов.
В 1964 году Ванькович подписал знаменитое «Письмо 34-х», адресованное тогдашним властям ПНР и резко критикующее культурную политику страны. За этим последовала травля писателя. Его обвинили в том, что он передает за границу материалы, клевещущие на Польшу, и сотрудничает с радио «Свободная Европа». Начался судебный процесс, и Ваньковича приговорили к трем годам тюрьмы. В заключении он провел пять недель. Власти хотели, чтобы писатель обратился к ним с просьбой о помиловании. Этого не произошло, но приговор так и не был приведен в исполнение. Ванькович так и не отправился в тюрьму.
В 1970 году писателю после многолетних мытарств дали польское гражданство, а кроме того, вернули членство в польском ПЕН-клубе.
Мельхиор Ванькович скончался в Варшаве 10 сентября 1974 года. Он похоронен на кладбище Повонзки.