Studiował w Państwowej Wyższej Szkole Muzycznej w Warszawie w klasie organów Joachima Grubicha.
Koncertował w kraju (m.in. podczas festiwali organowych we Fromborku, w Kamieniu Pomorskim, Koszalinie i Gdańsku-Oliwie) oraz za granicą: w Austrii, Belgii, Białorusi, Czechach, Danii, Estonii, Finlandii, Francji, Hiszpanii, Holandii, Korei Południowej, Litwie, Norwegii, Niemczech, Rosji, Słowacji, Szwajcarii, Szwecji, Ukrainie i Włoszech.
Dokonał nagrań dla Polskiego Radia m.in. dzieł Johannesa Brahmsa, Augusta Freyera, utworów z tabulatur polskich XVI-XVIII wieku. Utrwalił swe interpretacje na kilkunastu płytach kompaktowych wydanych w Anglii, Belgii, Korei Południowej i w Polsce (m.in. dla Polskich Nagrań i Acte Préalable). Jako jedyny polski organista posiada Złotą (1999) i Platynową Płytę (2000). We wrześniu 2004 jego nagranie utworów Freyera uznane zostało przez miesięcznik "Muzyka21" za płytę miesiąca.
Wiktor Łyjak w swoim repertuarze ma wszystkie dzieła organowe Johanna Sebastiana Bacha, Brahmsa, Cesara Francka, Felixa Mendelssohna-Bartholdy i Wolfganga Amadeusa Mozarta, a także wszystkie koncerty organowe Georga Friedricha Haendla i Josepha Haydna.
Obok działalności artystycznej zajmuje się pracą naukową. Jest doktorem nauk humanistycznych Polskiej Akademii Nauk. Habilitację w zakresie wiedzy o sztuce uzyskał na Uniwersytecie Wrocławskim. Opublikował ponad sto prac z zakresu dziejów budownictwa organowego i historii muzyki polskiej, m.in. jest autorem książek: "Organy na Mazowszu" (I nagroda Generalnego Konserwatora Zabytków w 2006), "Organy w kościołach ewangelickich w Królestwie Polskim w latach 1815-1864", "Organy na Mazowszu. Tom II". Jest też twórcą hasła o polskich organach w niemieckiej encyklopedii "Die Musik in Geschichte und Gegenwart". Jako rzeczoznawca Ministra Kultury w zakresie dokumentacji i konserwacji zabytkowych organów oraz rzeczoznawca Stowarzyszenia Konserwatorów Zabytków i Fundacji Współpracy Polsko-Niemieckiej w tej specjalności, bierze udział w pracach związanych z rekonstrukcjami zabytkowych organów, konsultuje projekty powstających współcześnie instrumentów. Jako ekspert powoływany przez Wspólnotę Polską działa także na Białorusi, Litwie i Ukrainie. Jest członkiem Rady Naukowej Krajowego Ośrodka Badań i Dokumentacji Zabytków, gdzie zajmuje się sprawami inwentaryzacji polskich organów. Dla Telewizji Polonia zrealizował cykl programów "Ars Organi" o dawnych organach w Polsce.
Wiktor Łyjak od wielu lat czynnie udziela się w warszawskich kościołach. Był organizatorem letnich koncertów organowych w kościele Świętego Krzyża, a w latach 1976-83 pełnił tam obowiązki organisty. Od przeszło ćwierćwiecza, jako tytularny organista, gra w Kościele Prokatedralnym (Seminaryjnym). Kieruje również Międzynarodowym Festiwalem Organowym "Johann Sebastian Bach", organizowanym przez Warszawskie Towarzystwo Muzyczne. W WTM pełni funkcję zastępcy Sekretarza Zarządu.
Wykłada, na stanowisku profesora nadzwyczajnego, na Uniwersytecie Humanistyczno-Przyrodniczym Jana Kochanowskiego w Kielcach, gdzie w Instytucie Edukacji Muzycznej kieruje Zakładem Historii, Teorii i Edukacji Muzycznej. Ponadto jest profesorem w Chrześcijańskiej Akademii Teologicznej w Warszawie.
Autor: Anna Iwanicka-Nijakowska, Polskie Centrum Informacji Muzycznej, Związek Kompozytorów Polskich, grudzień 2006, aktualizacja: Małgorzata Kosińska, Polskie Centrum Informacji Muzycznej, Związek Kompozytorów Polskich, listopad 2010.