Naukę gry skrzypcach rozpoczęła w wieku 6 lat w Państwowej Podstawowej Szkole Muzycznej w Krakowie. Następnie uczyła się w Liceum Muzycznym w Krakowie (dyplom z wyróżnieniem). Ukończyła naukę gry na skrzypcach pod kierunkiem Barbary Śliwickiej w Akademii Muzycznej w Krakowie (dyplom z wyróżnieniem w 1997 r.) oraz podyplomowe studia mistrzowskie w klasie prowadzonej przez Kwartet Melos w Staatliche Hochschule für Musik und Darstellende Kunst w Stuttgarcie (1997-2004 r.) oraz kontynuowała indywidualne studia u Wilhelma Melchera. Swoje umiejętności jako solistka i kameralistka doskonaliła podczas takich kursów mistrzowskich, jak: Internationale Bach-Akademie (Kraków/Stuttgart) pod kierunkiem Helmutha Rillinga, Internationale Sommer-Akademie w Pommersfelden u Antonína Moravca, Accademia Musicale Chigiana w Sienie w klasie kwartetu Piero Farulliego, Kurs letni z Kwartetem im. Aleksandra Borodina w Portogruaro.
Artystka od 1993 r. jest członkiem Kwartetu Smyczkowego Dafô. Wspólnie z zespołem uzyskała wiele nagród na międzynarodowych konkursach, m.in.: I nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Muzyki Kameralnej im. Kiejstuta Bacewicza w Łodzi (1995 r.), I nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Współczesnej Muzyki Kameralnej im. Valentino Bucchiego w Rzymie (1995 r.), IV nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Kwartetów Smyczkowych im. Dmitrija Szostakowicza w Sankt Petersburgu (1996 r.), III nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Kulturkreis der Deutschen Wirtschaft w Monachium (1997 r.), I nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Współczesnej Muzyki Kameralnej im. Krzysztofa Pendereckiego w Krakowie (1997 r.), II nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Kwartetów Smyczkowych w Cremonie (1998 r.), II nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Kwartetów Smyczkowych w Bubenreuth (1998 r.), I nagrodę na Konkursie Kwartetów Smyczkowych w Katowicach (1998 r.), III nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Muzyki Kameralnej im. Gaetano Zinettiego w Sanguinetto (1999 r.) oraz nagrodę specjalną jury na Międzynarodowym Konkursie Muzyki Kameralnej im. Józsefa Joachima w Weimarze (1999 r.).
Justyna Duda brała udział w takich festiwalach, jak "Warszawska Jesień", "Kwartet Śląski i Jego Goście", Dni Muzyki Karola Szymanowskiego, Dni Kompozytorów Krakowskich, Okada Festival, Krakowskie Wieczory Kameralne, "Bravo Maestro", Wielkanocny Festiwal im. Ludwiga van Beethovena, Festiwal Muzyki Polskiej, Schleswig-Holstein Music Festival, Kissinger Sommer, Obersdorfer Musiksommer Festival, Sachsen Musikfest, Ludwigsburger Musikfestspiele, Europäische Wochen Passau, Heidelberger Frühling, Festspiele Mecklenburg-Vorpommern, Gammertinger Schlosskonzerte, Setimana Internacional Música de Cambra Montserrat València, Festival im Herzogschloss, Europalia, Festival Van Vlaandern, Ostbelgien Festival, Bergische Biennale Neue Musik, Festival Euro Mediterraneo, Bodenseefestival, Musikfestival von Colmar, Falsterbonäsets kammarmusikdagar, Festival du Périgord Noir, Festival d'Ile de France, Usedomer Musikfestival oraz w festiwalu muzyki Krzysztofa Pendereckiego w Armenii.
Wraz z Kwartetem Dafô dokonała nagrań dla radia, telewizji i wytwórni fonograficznych. Dwie płyty wydane przez PWM/DUX zostały uhonorowane Fryderykami – Nagrodami Polskiej Akademii Fonograficznej: w 1999 r. za "Polskie kwartety smyczkowe XX wieku. Część I", w 2002 r. za "Polskie kwartety smyczkowe XX wieku. Część II". Dwupłytowy album – z "Kwintetem smyczkowym" Franza Schuberta z udziałem Petera Bucka oraz kwartety smyczkowe Karola Szymanowskiego i Henryka Mikołaja Góreckiego – zespół nagrał dla Fundacji Roberta Boscha i stacji SWR. Płyta z udziałem zespołu: "Paweł Mykietyn: Speechless Song" (Polskie Wydawnictwo Audiowziualne), otrzymała nagrodę "Fryderyk 2009" w kategorii "Album Roku Muzyka Współczesna".
Od 2005 r.współpracuje z orkiestrą Sinfonietta Cracovia pod batutą Roberta Kabary. Od 2007 r. prowadzi jednocześnie wykłady w Katedrze Kameralistyki Akademii Muzycznej w Krakowie.
Justyna Duda przez wiele lat grała na XVIII- i XIX-wiecznych instrumentach francuskich, należących do kolekcji instrumentów smyczkowych Badenii-Wirttembergii.
Autor: Małgorzata Kosińska, Polskie Centrum Informacji Muzycznej, Związek Kompozytorów Polskich, listopad 2007, aktualizacja: listopad 2010.