Naukę gry na fortepianie rozpoczął w wieku 8 lat. Studiował w Akademii Muzycznej w Warszawie: w klasie fortepianu Anny Jastrzębskiej-Quinn (dyplom z wyróżnieniem w 2005) oraz muzykę kameralną u Krystyny Borucińskiej. Jednocześnie odbył studia na Politechnice Warszawskiej. Od 2005 kontynuuje naukę w Hochschule für Musik und Theater w Hamburgu w klasie mistrzowskiej Evgenija Koroliova. Przygotowuje również doktorat pod kierunkiem Alicji Palety-Bugaj w Akademii Muzycznej w Warszawie. Swoje umiejętności doskonalił na kursach mistrzowskich m.in. w Dusznikach-Zdroju, Catanii (Włochy) i Weikersheim (Niemcy). Pracował z takimi profesorami, jak Halina Czerny-Stefańska, Andrzej Jasiński, Valery Kozlow, Victor Makarov, Tatiana Szebanowa, Jan Micheils, Wiera Gornostajewa, Epifanio Comis, Inge-Susann Römhild i Artemis Quartett. W marcu 2005, jako jedyny reprezentant Polski, brał udział w warsztatach The 10th International Hamamatsu Piano Academy, gdzie miał okazję współpracować z Hiroko Nakamurą, Piero Rattalino, Piotrem Palecznym, Michelem Béroffem oraz Arie Vardim.
Otrzymał wiele nagród i wyróżnień na konkursach, m.in. w 1994 - III nagrodę na Ogólnopolskim Konkursie Pianistycznym im. Ludwika Stefańskiego w Płocku, w 1999 - III nagrodę na Międzynarodowym Konkursie Pianistycznym im. Fryderyka Chopina w Wilnie, w 2000 - I nagrodę i nagrodę specjalną (w postaci koncertów promocyjnych w Berlinie oraz w Studiu Koncertowym Polskiego Radia im. Witolda Lutosławskiego w Warszawie) na 4. Festiwalu Młodych Pianistów w Siedlcach, w 2006 - wyróżnienie "Medalla per Unanimitat" na 52. Maria Canals International Piano Competition w Barcelonie, II nagrodę na 15. Elise Meyer Wettbewerb w Hamburgu i Grand Prix na 3. Konkursie na projekt nagraniowy "Zapomniana Polska" Wydawnictwa Muzycznego Acte Préalable (nagranie dzieł fortepianowych Juliana Fontany), w 2007 - I nagrodę na Konkursie Chopinowskim w Hanowerze, w którym nagrodą było stypendium. Ponadto jest stypendystą Krajowego Funduszu na Rzecz Dzieci (2001), Ministra Kultury i Dziedzictwa Narodowego (2002, 2004), Budge Stiftung oraz Otto Stoterau Stiftung w Hamburgu.
Hubert Rutkowski jako solista występował w Polsce (m.in. w Filharmonii Narodowej w Warszawie oraz Filharmonii im. Feliksa Nowowiejskiego w Olsztynie), we Włoszech, w Niemczech, Hiszpanii, na Litwie, Cyprze, Kubie, w Japonii i Peru. W 2004 wystąpił na Międzynarodowym Festiwalu Muzycznym w Catanii, w ramach którego grał z Orchestra Sinfonica Giovanile Internazionale pod dyrekcją Tomasza Bugaja, jak również dał recitale solowe oraz brał udział w koncertach kameralnych na Sycylii. W tym samym roku uczestniczył w multimedialnym projekcie Katarzyny Kozyry, prezentowanym m.in. w Narodowej Galerii Sztuki "Zachęta" w Warszawie, Postmasters Gallery w Nowym Jorku, Kunsthaus w Grazu, Galleria Civica d'Arte Contemporanea w Trydencie oraz Kunsthalle w Wiedniu.
Dokonał nagrań archiwalnych dla niemieckich rozgłośni SüdWestRundfunk oraz NDR Rundfunk. Dla Acte Préalable zarejestrował też utwory fortepianowe Teodora Leszetyckiego.
Hubert Rutkowski jest założycielem i prezesem Towarzystwa Muzycznego im. Teodora Leszetyckiego w Warszawie.
Strona internetowa artysty: www.hubertrutkowski.com
Autor: Anna Iwanicka-Nijakowska, Polskie Centrum Informacji Muzycznej, Związek Kompozytorów Polskich, grudzień 2006, aktualizacja: Małgorzata Kosińska, Polskie Centrum Informacji Muzycznej, Związek Kompozytorów Polskich, lipiec 2010.