Koncepcję modernizacji opracowało Biuro Projektowe AIR Jurkowscy. Ceglanych elewacji zabytku nie zmieniono, natomiast dyspozycja pomieszczeń na wszystkich kondygnacjach podporządkowana została potrzebom ekspozycji, a wewnętrzny dziedziniec przykrył szklany dach o lekkiej stalowej konstrukcji. Stanęły tutaj wielkogabarytowe eksponaty.
Scenariusz ekspozycji Muzeum, wzorowany na rozwiązaniach z Muzeum Powstania Warszawskiego, opracowali historycy we współpracy profesorem Maciejem Radnickim z krakowskiej ASP. Zamiast tradycyjnych gablot zaprojektowano modele, makiety oraz iluzje scenograficzne. Historia ma oddziaływać na wszystkie zmysły.
Zwiedzający na parterze trafią na nowoczesny punkt obsługi, szatnie, kawiarenkę i sklepik z pamiątkami. Tu jest miejsce na wystawy czasowe oraz ekspozycję obejmującą okres obu wojen światowych. Piwnice, w których znajdował się schron dowództwa, mieszczą wystawę stałą omawiającą dzieje Polskiego Państwa Podziemnego. Pierwsze piętro ma charakter bardziej zróżnicowany; miejsce dla wystaw, biblioteka z czytelnią, sala audiowizualna na konferencje i prezentacje. Poddasze przeznaczono na część administracyjno – biurową.
W otoczeniu budynku studenci architektury krajobrazu z Politechniki Krakowskiej przygotowali koncepcje założenia Parku Armii Krajowej.
Autorka: Alicja Gzowska